Light Yagami es uno de los estudiantes más inteligentes de Japón, que
deseaba acabar con todos los criminales que lo rodeaban. Un día, su vida sufre
un cambio radical, cuando encuentra un extraño cuaderno sobrenatural, llamado «Death
Note», tendido en el suelo. Detrás del Death Note había
instrucciones sobre su uso, donde decía que si se escribía el nombre de una
persona y se visualiza mentalmente el rostro de ésta, moriría de un ataque al
corazón. Al principio, Light desconfiaba de la autenticidad del cuaderno, pero
después de probarlo en dos ocasiones, se da cuenta que su poder es real.
Después de cinco días, recibe la visita del verdadero dueño del Death Note,
un shinigami llamado Ryuk, que le cuenta que dejó caer el Death Note a
la Tierra porque se encontraba aburrido, y a su vez Light le cuenta a Ryuk que su
objetivo es matar a todos los criminales, para así limpiar al mundo de la
maldad y convertirse en el «dios del nuevo mundo».
Más tarde, el número inexplicable de muertes de criminales llamaría la
atención del FBI y la de un famoso detective privado conocido como «L». L
deduce rápidamente que el asesino en serie, apodado por el público como «Kira»
(キラ, '«Kira»'
derivado de la típica pronunciación japonés de la palabra inglesa «killer»,
lit. «asesino»), se encuentra en Japón. Asimismo se da cuenta que Kira
puede matar a las personas sin necesidad de poner un dedo sobre ellas. Light
descubre que L será uno de sus mayores némesis, y se producirá un juego
psicológico del gato y el ratón entre ellos.
Misa Amane, otra portadora de un Death Note, se encuentra con Light.
Obsesionada con Kira tras dar muerte al asesino de sus padres, se dedica a
ayudar a Light, haciéndose pasar por el segundo Kira,
pero es capturada y encerrada por L, ya que sospechaba de ella. Light traza un
plan para renunciar a la propiedad de ambos Death Note, tanto el suyo
como el de Misa, y así olvidar los recuerdos de éstos para poder rescatarla,
sometiéndose a la vigilancia de L. Después de perder sus recuerdos, Light es
liberado para comenzar a investigar con L sobre un grupo de delincuentes
llamados «Yotsuba», que poseían el Death Note de Misa. Al
detenerlos, Light recupera todos sus recuerdos cuando había tocado el Death
Note. Rem, una shinigami encargada del cuidado del Death Note de
Misa, es manipulada por Light para que actúe a su favor, matando a L y a su
asistente, Watari. Dado que incumple una de las reglas del Death Note,
poco después Rem muere, aumentando el tiempo de vida de Misa.
Después de la muerte de L, Light asume el cargo de «nuevo L» en el grupo de
investigación. Cinco años más tarde, aparecen Near y Mello, los verdaderos
sucesores de L, que se dividen para ver quien podrá atrapar a Kira primero.
Near, con ayuda del gobierno crea el SPK, una organización fundada con el
objetivo explícito de capturar a Kira, mientras que Mello hace un trato con la mafia
para lograr el mismo objetivo. Mello comienza a ejecutar su plan y a investigar
sobre los poderes Death Note, mientras que Near —haciéndose pasar por L—
contacta con Light, quien también se hacía pasar por L. Light no esperaba que L
tuviera sucesores, por lo que tendría que evadir nuevamente las deducciones de
éstos, para así poder cumplir sus ambiciones.
Posteriormente, Light decide contratar a una persona para que lo reemplace
por un tiempo en su trabajo como Kira, ya que Near estaba empezando a sospechar
de él y Misa ya no le servía, así que escoge a Teru Mikami, un hombre que
admira a Kira como a un dios. Mello, con ayuda de su amigo Matt, secuestra a Kiyomi
Takada, ya que sospechaban que ésta tenía relación con Kira. Matt muere
ametrallado, tras una persecución por los guardaespaldas de Takada, dándole la
oportunidad a Mello de huir. Mello muere a manos de Takada, quien poseía un
trozo del Death Note, pero más tarde Takada es asesinada por Light. Por
otro lado, Near hace contacto con Light y su equipo para llevar a cabo una
reunión. Light aprovecha la oportunidad para comunicarle a Mikami que
investigue sobre los verdaderos nombres de los miembros del SPK. Cuando el día
de la reunión había llegado, Mikami había escrito todos los nombres del SPK en
el Death Note, Near explica que no pasará nada, ya que con ayuda de Stephen
Gevanni había cambiado ese Death Note por uno falso. Light, al sentirse
acorralado por las deducciones de Near, revela que todo es cierto e intenta
matarlo con un trozo de Death Note que tenía en su reloj, pero fue
disparado, quedando mal herido. Al ver que no podía hacer nada, escapa y va
recordando todo lo que vivió, mientras que Mikami se suicida ya que Light había
sido derrotado. Al final, Ryuk escribe el nombre de Light en su Death Note
y éste muere.